Protože se Česká republika zavázala k převzetí schengenských úmluv, musí letiště do konce letošního roku upravit stávající odbavovací budovu tak, aby bylo možné odděleně odbavovat cestující ze zemí schengenského prostoru. Tento prostor zahrnuje území států, na jejichž společných hranicích nejsou vykonávány hraniční kontroly. Kontrola se soustředí na tzv. vnější schengenské hranice a je doprovázena součinností bezpečnostních složek. V současné době jsou do spolupráce v rámci Schengenu zapojeny všechny státy evropské patnáctky s výjimkou Velké Británie a Irska, které se podílejí pouze na některých aspektech úmluv. V případě karlovarského letiště je zásadní věcí zajistit dostatečný komfort pro souběžné odbavení schengen i non-schengen cestujících ze dvou dopravních letadel s kapacitou až 180 cestujících. Jinak by letišti nebyl přiznán statut mezinárodního letiště s vnější hranicí.
Náklady na tento projekt se ve své první části budou pohybovat okolo 50 milionů korun, přičemž cca 20 milionů korun bylo Karlovarskému kraji poskytnuto z Norských finančních mechanismů. Tyto fondy byly založeny v roce 2004 a kladou si za cíl do roku 2009 poskytnout finanční pomoc deseti novým členským státům EU. Z Norských finančních mechanismů budou financovány formou výzev ty projekty, které nespadají do žádné z kategorií regionální pomoci z Bruselu. Hlavním cílem Norska je snížení sociálních a ekonomických nerovností v Evropském hospodářském prostoru. Druhá část III. etapy modernizace letiště, tedy výstavba nové haly, přijde na 92, 5 milionu korun a pro její financování se počítá s dotací z fondů EU.
Zhotovitelem projektu bude Sdružení Letiště Karlovy Vary - III. etapa, účastníků sdružení Stavby silnic a železnic, a.s. a Průmstav Praha, a.s. Rekonstrukce stávající odbavovací budovy by měla být dokončena nejpozději do konce roku 2007, předpokládaný termín dokončení nové haly závisí na přidělení finančních prostředků z fondů EU pro plánovací období 2007 - 2013.
Třetí etapa modernizace letiště Karlovy Vary navazuje na dvě předchozí, které zahrnovaly rekonstrukci vzletové a přistávací dráhy a rovněž kompletní rekonstrukci světelného zabezpečovacího zařízení. Tato etapa završí společnou snahu Karlovarského kraje a letiště odbavovat cestující podle mezinárodních úmluv, s maximálním komfortem a v odpovídajících prostorových podmínkách.
